Q.ハッチの蓋にある防水パッキンが破損していることがわかりましたが、どうすればいいですか？

パッキン優先して交換してください。この状態の場合、絶対に水に浸けたり、水をかけたりしないでください。水が機体内部に侵入し電子部品の故障に繋がります。